Коренной сибиряк, родился в с. Карасуль, Ишимского района, Тюменской области, в крестьянской семье 27 февраля 1952 года. Русский.

Окончил два факультета Тюменского индустриального института. Один очно в 1974 году (инженер-электрик по автоматике и телемеханике), второй, заочно в 1980 году по специальности горный инженер по технологии и комплексной  механизации разработки нефтяных и газовых  месторождений, доктор экономических наук (2006г.).

Профессиональный путь нефтяника прошел от слесаря на промысле до Министра топлива и энергетики России. Работая на инженерных должностях всегда большое значение придавал  организации производства, новым методам работы, передовому опыту.

С 1974 года работал на предприятиях производственного объединения "Нижневартовскнефтегаз" слесарем-механиком, инженером-технологом, старшим инженером, начальником лаборатории.

В 1980 году с первых дней начала работ по обустройству нового Урьевского нефтяного месторождения работает во вновь образованном НГДУ "Урьевнефть". Вначале начальником центральной инженерно-технологической службы, затем главным инженером, начальником НГДУ, а с образованием производственного объединения "Лангепаснефтегаз" -  генеральным директором  (последнюю должность занимал с 1987 по 1990 год).

Начав работать на Самотлорском месторождении, затем принимал непосредственное участие в освоении и обустройстве Ван-Еганского, Локосовского, Покамасовского, Поточного, Урьевского нефтяных месторождений в Западной Сибири.

14 апреля 1990 года в результате альтернативных выборов из 8-ми кандидатур был избран Председателем Тюменского областного Совета народных депутатов. По инициативе Ю.К.Шафраника Тюменский областной Совета народных депутатов в декабре 1990 года утвердил Концепцию развития Тюменской области, в основе которой был заложен механизм введения платности недропользования. Однако нормативно-законодательная база в стране по этой проблеме полностью отсутствовала. В связи с этим Ю.К. Шафраник выступил с предложением перед Верховным Советом РСФСР о необходимости разработки и принятия Закона "О недрах". На этапе подготовки проекта Закона  входил в состав рабочей группы и активно в ней работал.

Длительность процесса подготовки и принятия Закона и острые социальные проблемы области заставили Шафраника искать иные пути решения вопросов платности недр. К июню 1991 года был подготовлен, а в сентябре 1991 года подписан Президентом Указ N122 "О развитии Тюменской области", в котором определены как стратегические направления - введение платности недропользования, создание вертикально-интегрированных компаний, рыночный механизм формирования цен на нефть и т.п. Указ оказал значительное влияние на социально-экономическое развитие области и дальнейшее реформирования нефтегазовой отрасли.

В сентябре 1991 года Ю.К. Шафраник Указом Президента России назначен Главой администрации Тюменской области. Учитывая сложное административно-территориальное строение Тюменской области по инициативе Шафраника в области образован Административный Совет, в который вошли руководители администраций и территориальных Советов, что позволяло безконфликтно сотрудничать и развиваться всем трем субъектам Федерации.

При активном участии Ю.К.Шафраника в г. Тюмени в 1992 году прошло первое организационное заседание Союза нефтепромышленников.
С января 1993 года Шафраник - Министр топлива и энергетики Российской Федерации.

12 декабря 1993 г. Ю.К. Шафраник избран депутатом Совета Федерации от Ханты-Мансийского автономного округа являлся членом Комитета Совета Федерации по вопросам экономической реформы, собственности и имущественных отношений.

В 1993-1995 годах активно идет формирование абсолютно новых для России структур - вертикально интегрированных компаний в нефтяной промышленности. Как Министр топлива и энергетики, Ю.К. Шафраник принимает участие в формировании всех структур, отработке с Правительством Российской Федерации и руководителями органов власти субъектов Федерации состава нефтяных компаний, подготовке соответствующих постановлений. Основные тенденции структурных преобразований в нефтяной промышленности были сформулированы в Концепции развития нефтяной промышленности России, подготовленной по поручению Правительства РФ Минтопэнерго России.
 
Шафраник Ю.К. возглавил разработку концепции, а затем и подготовку Энергетической стратегии России, определившей задачи, механизмы и направления обеспечения энергетической безопасности. Ю.К.Шафраник впервые поднял и обосновал проблему энергетической дипломатии и связал ее с энергетической безопасностью. Совместно с МИД России Ю.К.Шафраник организовал и провел ряд "круглых столов" по этим проблемам, результатом чего было проведение двух международных консультативных совещаний "Россия - Европа: стратегия энергетической безопасности" и "Энергетическая безопасность СНГ", проведенных в 1995 и 1996 годах.
 
В 1993 году Ю.К. Шафраник создает Московский международный нефтяной клуб, объединивший президентов российских и мировых нефтяных компаний.

При активном участии Шафраника Россия входит в масштабные международные проекты, такие как Каспийский трубопроводный консорциум, в котором он долгие годы являлся Председателем Совета директоров. Настойчивая работа Шафраника обеспечила принятие Закона "О соглашениях о разделе продукции", что позволило начать реализацию международных проектов "Сахалин 1 и 2".
Учитывая распад СССР и разрыв традиционных экономических связей, Ю.К. Шафраник подготовил и провел организационную конференцию по созданию Межправительственного Совета по нефти и газу стран - членов СНГ.
 
В 1993 году Ю.К. Шафраник инициировал разработку программ развития и структурной перестройки нефтяной, угольной промышленности и электроэнергетики, а также возглавил творческие рабочие группы по каждой из отраслей. Результатом явилась подготовка и внесение в Правительство Российской Федерации Программы закрытия нерентабельных шахт и  шахт с опасными условиями труда, а также Концепции  управления нефтяной промышленностью России.

Шафраник неоднократно обосновывал и последовательно отстаивал идею необходимости создания Национальной нефтяной компании, которую предлагал создать на базе ГП "Роснефть". По мнению Шафраника в России целесообразно формирование 5-6 мощных нефтяных компаний. Однако под давлением различных сил, которые действовали в Правительстве, в Администрации Президента, а также влиятельных региональных лидеров число нефтяных компаний перевалило за десяток.

Отставка Шафраника летом 1996 года во многом была связана  с его особой позицией в отношении государственного регулирования ТЭК, а также неприятия залоговых аукционов и высоких темпов приватизации объектов нефтяного комплекса России.

С августа 1996 по апрель 1997 года Ю.К. Шафраник работает Советником Председателя Правительства Российской Федерации.

В мае 1996 года он избран в состав Совета директоров ОАО "Тюменская нефтяная компания", а с августа являлся его Председателем. В этот период идет активная подготовка к инвестиционному конкурсу по продаже пакета акций ОАО "ТНК". В результате, в июле 1997 года 40% пакет акций ТНК был продан за рекордную для инвестиционных конкурсов сумму в 810 млн. долларов США. Это оказалось больше суммы, полученной за все инвестиционные конкурсы и залоговые аукционы, проведенные до этого.
 
В 1997 году Ю.М. Лужков предлагает Шафранику возглавить Центральную топливную компанию, которая, даже не смотря на известные общероссийские экономические и финансовые проблемы, в короткое время уверенно заняла свою нишу на  региональном оптовом рынке нефтепродуктов. Уже по итогам 1998 года ОАО "Центральная топливная компания" по оценке журнала "Эксперт" входит в двадцатку самых эффективных и прибыльных компаний России.

Из-за разницы в подходах к стратегии дальнейшего развития ОАО "ЦТК", в январе 2001 года Шафраник Ю.К. уходит из ЦТК вместе со всей командой менеджеров и активно включается в деятельность Межгосударственной нефтяной компании "СоюзНефтеГаз", в которой с августа 2000 года являлся Председателем Совета директоров, а с сентября 2001 становится Председателем Правления.

Межгосударственная нефтяная компания "СоюзНефтеГаз" была создана в июле 2000 года и по составу акционерного капитала является государственной компанией. Основными ее акционерами являются Межгосударственный банк, белорусский государственный концерн "Белнефтехим". Компания намерена реализовывать проекты на пространстве стран СНГ, прежде всего с Республикой Беларусь, а также на Ближнем Востоке.

Шафраник Ю.К. является Председателем Высшего горного Совета. Избран Председателем Совета Союза нефтегазопромышленников России (2002г.), членом Президиума Горной академии, академии технологических наук, Международной академии топливно-энергетического комплекса. Является Председателем Комитета Торгово-промышленной палаты России по энергетической стратегии и развитию топливно-энергетического комплекса, Президентом Фонда "Мировая политика и ресурсы", членом Попечительского совета Фонда Михаила Шемякина.

Люди хорошо знающие Шафраника отмечают его ярко выраженную целеустремленность в достижении поставленных задач. Обладает широким государственным кругозором, пристально следит и анализирует обстановку не только в нефтегазовой отрасли, где он является признанным экспертом экстра-класса, но и в политической и экономической сферах. Обладает высокой работоспособностью. Увлекается горнолыжным спортом, любит книги и театр.

Награжден орденами "Дружбы народов" (1988 г.), Почета (2000 г.), медалями: Лауреат Премии Правительства Российской Федерации (1999 г.). В 2002 году, награжден Орденом Русской Православной церкви "Святого Благоверного князя Даниила Московского" II степени.
Мать - Шафраник Галина Дмитриевна, 1929 года рождения, до выхода на пенсию трудилась на различных работах в колхозе, работала в сельском совете.

Отец - Шафраник Константин Иосифович, 1927 года рождения, до выхода на пенсию водитель. Родители коренные сибиряки, родились и проживают в селе Карасуль Тюменской области. Неоднократно удостаивались правительственных наград.

Жена - Шафраник Татьяна Александровна, окончила Тюменский индустриальный институт. По специальности - инженер АСУ.

Дочь - Инга, учится в аспирантуре.

Сын - Денис. Студент.

Брат - Шафраник Сергей Константинович, 1956 года рождения, горный инженер, президент ОАО "СИНКО".